Dextransulfat 500 - Natriumsalz Biochemica
CAS-Nr.: 9011-18-1, HS-Nr.: 39139000
Lagerung: 2 bis 8°C, LGK: 13, Entsorgung: 3, Giftklasse (CH): F, WGK: nwg, hygroskopisch
Spezifikation:
- DNasen/RNasen/Proteasen.....nicht nachweisbar
- durchschnittliches M.....ca. 500.000 g/mol
- Löslichkeit (10%, H2O).....klar, farblos
- pH (1%, H2O).....5,0 bis 7,5
- Sulfatasche.....40 bis 50%
- Trocknungsverlust max. 10%
- Chlorid max. 0,1%
- Fe max. 0,0002%
Dextransulfat ist ein Heparin-ähnliches Polysaccharid, das die Hybridisierungsrate von Nukleinsäuren in Abhängigkeit von der verwendeten Probe zwischen dem 3fachen und100fachen Wert erhöht (2-4). Dies erfolgt durch eine Verringerung des Volumens der DNA-haltigen Lösung durch das Polymer, wodurch die DNA konzentriert wird(1,4).Man sollte aber nur dann von Dextransulfat Gebrauch machen, wenn die Hybridisierungsrate oder die DNA-Menge einen begrenzenden Faktor für die Identifizierung 'seltener' Sequenzen darstellt. Der Effekt von Dextransulfat ist für Polynukleotide mit > 250 Nukleotiden am höchsten. Für Oligonukleotide < 14 Basen ist kein Effekt zu verzeichnen. Für die Hybridisierung von bakteriellen Kolonien oder Plaques bedeutet die Anwendung ebenfalls keinen Vorteil. Unter Umständen kann es sogar zu einem hohen Hintergrund führen. Die Hantierung einer Dextransulfat-Lösung wird zusätzlich durch die hohe Viskosität der Lösung erschwert (4).Eine 50%ige Stammlösung ist leicht gelblich (2), die Arbeitskonzentration ist 10 %. Wenn wässrige Dextransulfat-Lösungen autoklaviert werden sollen, müssen sie, z. B. mit Natriumbicarbonat, gepuffert werden, um eine Zersetzung während des Autoklavierens zu verhindern.
Literatur:
- (1)Wetmur, J.G. (1975) Biopolymers 14, 2517-2524 Erhöhung der DNA-Renaturierungsrate.
- (2)Wahl, G.M. et al. (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76, 3683-3687 Transfer von DNA aus Agarosegelen auf Filterpapier und schnelle Hybridisierung.
- (3)Meinkoth, J. & Wahl, G. (1984) Anal. Biochem. 138, 267-284 Übersichtsartikel : Hybridisierung von immobilisierten Nukleinsäuren.
- (4)Sambrook, J., Fritsch, E.F. & Maniatis, T. (1989) Molecular Cloning : A Laboratory Manual, 2nd Edition S. 9.50. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York.
